Secuenciación de DNA por Nanoporos Biológicos

El grupo de nanoporos de Harvard, está trabajando en la utilización de nanoporos para la secuenciación de DNA, según ellos, esta técnica debería rsultar mucho más económica que las tecnicas convencionales y modernas de secuenciación, aunque sería más que nada para secuenciación de novo.

El principio de funcionamiento es el siguiente. Se hacen pasar las moléculas una hebra simple de ADN o ARN por el nanoporo impulsada por un campo eléctrico. La molécula atraviesa el poro en su forma lineal y a medida que pasa cambia las propiedades eléctricas del mismo. Esto se debe a que se obstruye el pasaje de iones a travez del mismo, diferencialmente según la base. Si se registran estas corrientes se puede saber que base está obstruyendo el poro. En el estado actual si bien la diferenciación de bases es buena, la resolución no es todavía suficiente. Sin embargo, se está trabajando con nonoporos de estado sólido con resultados prometedores.

Si bién la tecnología está aun en desarollo, las expectativas son altas.

"We are investigating and developing the basic science and technology required to build a nanopore based instrument that should be able to sequence a mammalian genome for <$1,000 and that meets the following requirements: a. High-speed sequential identification of the DNA's nucleotides directly on the basis of their distinct physical or electrical properties; b. Very long, indefinite length reads. Analysis and assembly is a bottle-neck in de novo sequencing and limits re-sequencing when copy number polymorphism or variable indels are to be identified in heterozygous genomes; c. The requisite sequence coverage (7.7-fold coverage, 6.5-fold coverage in Q20 bases) using genomic DNA from <10⁶ cells with no amplification and minimal preparative steps. Otherwise, amplification or other preparatory steps become limiting."

Este grupo ya ha demostrado que la tecnología es factible. Para más información vean la página:
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